Sítio segregante
Sítios segregantes são posições que mostram diferenças (polimorfismos) entre genes relacionados em um alinhamento de sequências (não são conservadas).[1][2] Sítios segregantes incluem mutações conservativas, semi-conservativas e não conservativas.
A proporção de locais de segregação dentro de um gene é uma estatística importante em genética de populações já que podem ser usados para estimar taxa de mutação assumindo que não há seleção. Por exemplo, é usado para calcular a estatística de evolução neutra de Tajima D.[3][4]
Sequências são os aminoácidos para resíduos 120-180 das proteínas. Resíduos que são conservados em todas as sequências são destacadas em cinza. Abaixo das sequências de proteínas é uma chave denotando sequência conservada (*), mutações conservativas (:), mutações semi-conservativas (.) e mutações não-conservativas ( ).[5]
Referências
- ↑ Daniel L. Hartl, Andrew G. Clark; Princípios de Genética de Populações - 4.ed. Artmed Editora, 2010. pg 53
- ↑ Fu, YX (outubro de 1995). «Statistical properties of segregating sites.». Theoretical population biology. 48 (2): 172–97. PMID 7482370. doi:10.1006/tpbi.1995.1025
- ↑ Daniel Živković and Thomas Wiehe; Second-Order Moments of Segregating Sites Under Variable Population Size; Genetics. 2008 Sep; 180(1): 341–357. doi: 10.1534/genetics.108.091231
- ↑ Brian Charlesworth and Kavita Jain; Purifying Selection, Drift, and Reversible Mutation with Arbitrarily High Mutation Rates; Genetics. 2014 Dec; 198(4): 1587–1602. doi: 10.1534/genetics.114.167973
- ↑ «Clustal FAQ #Symbols». Clustal. Consultado em 8 de dezembro de 2014. Arquivado do original em 24 de outubro de 2016