Possui acervo com painéis, vitrines com fragmentos da civilização missioneira, provenientes das escavações realizadas nas Ruínas Jesuíticas de São Nicolau. Visitação: de segundassegunda asà sextassexta das 8as8 às 12h, e das 13:30 asàs 17:00. O museu está localizado na rua Salvador Pinheiro Machado, o telefone é (55) 33631034.
Ainda, posuipossui dentro do Sítio Arqueológico a Adega Jesuítica, construída em pedra de arenito, inclusive o teto. Devido a este fato resistiu ao tempo e permancepermanece em suas origemintacta até os dias de hoje. É única . aA adejaadega servia para armazenar vinhos que seriam consumidos pelos padres jesuítas.