Magnus era o terceiro filho do rei [[Cristiano III da Dinamarca]] e da duquesa [[Doroteia de Saxe-Lauenburg]]. Entre os seus irmãos estavamestava o rei [[Frederico II da Dinamarca]] e o rei [[Magnus da Dinamarca|Magnus da Livónia]]. Os seus avós paternos eram o rei [[Frederico I da Dinamarca]] e a margravina [[Ana de Brandemburgo]]. Os seus avós maternos eram o duque [[Magnus I de Saxe-Lauenburg]] e a duquesa [[Catarina de Brunswick-Wolfenbüttel]].<ref>[http://thepeerage.com/p10555.htm#i105545 The Peerage]</ref>
