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Linha 10: :<math>S_{ij}= \left( \frac{1}{\lambda} \right)\log{\left( \frac{p_{ij}}{q_i * q_j} \right)}</math> Aqui, <math>p_{ij}</math> é a probabilidade de dois aminoácidos <math>i</math> e <math>j</math> estarem substituindo uns aos outros em uma seqüência homóloga, e <math>q_i</math> e <math>q_j</math> são as probabilidades de fundo de encontrar os aminoácidos <math>i</math> e <math>j</math> em qualquer seqüência de proteína de forma aleatória. <!--▼ ▲<!-- Here, <math>p_{ij}</math> is the probability of two amino acids <math>i</math> and <math>j</math> replacing each other in a homologous sequence, and <math>q_i</math> and <math>q_j</math> are the background probabilities of finding the amino acids <math>i</math> and <math>j</math> in any protein sequence at random. The factor <math>\lambda</math> is a scaling factor, set such that the matrix contains easily computable integer values. ... The factor <math>\lambda</math> is a scaling factor, set such that the matrix contains easily computable integer values. An article in Nature Biotechnology<ref>{{cite journal\| year=2008\| journal=Nat. Biotech. \| volume=26 \| pages=274–275\| title = BLOSUM62 miscalculations improve search performance \| doi = 10.1038/nbt0308-274 \| url=http://www.nature.com/nbt/journal/v26/n3/full/nbt0308-274.html \| author = Mark P Styczynski \| coauthors = Kyle L Jensen, Isidore Rigoutsos, Gregory Stephanopoulos\| pmid=18327232\| issue=3 }}</ref> revealed that the BLOSUM62 used for so many years as a standard is not exactly accurate according to the algorithm described by Henikoff and Henikoff.<ref name=henikoff /> Surprisingly, the miscalculated BLOSUM62 improves search performance.{{cn\|date=September 2011}}

BLOSUM: diferenças entre revisões