A base bíblica da excomunhão é a [[anátema]]. As referências são encontradas em Gálatas{{citar bíblia|Gálatas|1:|8}} - "Mas, ainda que alguém - nós ou um anjo baixado do céu - vos anunciasse um evangelho diferente do que vos temos anunciado, que ele seja ''anátema''!" Então, também, 1{{citar bíblia|I Coríntios|16: |22}} - "Se alguém não amar ao Senhor, seja ''anátema''." A palavra pode ser traduzida de várias maneiras, a [[Bíblia do Rei Jaime|versão ''King James'']] traduz-o como '"amaldiçoado'".
O [[Novo Testamento]] contém limitado exemplos de excomunhão. Jesus, em Mateus{{citar bíblia|Mateus|18:|17}}, "Se recusa ouvi-los, dize-o à Igreja. E se recusar ouvir também a Igreja, seja ele para ti como um pagão e um publicano" Na epístola aos Romanos{{citar bíblia|Romanos|16:|17}}, Paulo escreve para "marcar aqueles que causam divisões contrário à doutrina que vos tenho aprendido e evitá-las", e em 1[[I Coríntios 5]], ele instrui os [[Corinto|coríntios]] para expulsar os membro imorais da sua comunidade. Além disso, noem 2.{{citar Jo, versículosbíblia|II João|1|10 e |11}}, o escritor aconselha: "Por isso, quando eu for aí, hei de recordar as obras que ele pratica, espalhando contra nós coisas más. Não contente com isto, ele não só recusa receber os irmãos, como até proíbe de recebê-los aos que quereriam fazer, e os exclui da comunidade".
Anátema foi utilizado também no início da igreja como uma forma de sanção extrema além da excomunhão. O primeiro exemplo foi gravado em [[306]] [[d.C.]].
