Durante a execução, os bongôs são colocados em um suporte com altura ajustada para que o [[percussionista]] possa tocá-lo de pé. Também é possível tocá-lo sobre o colo, ou preso entre as pernas, com cuidado para que as aberturas não sejam bloqueadas. O bongô é tocado com as mãos, por [[percussão]] da pele comdo as mãosinstrumento. Sons diferentes podem ser obtidos se a pele for golpeada no centro ou na beirada e também há variações de acordo com a parte da mão utilizada. A ponta dos dedos proporciona um som mais brilhante enquanto que a palma da mão gera um [[timbre]] abafado. Efeitos adicionais podem ser obtidas se uma das mãos for usada para pressionar a pele de um dos tambores, enquanto a outra é usada para bater. Isso permite variar a altura obtida pela mesma pele. Geralmente os dois tambores são tocados simultaneamente, - um sendo usado para os baixos, e o outro para asos notassons agudasagudos, proporcionando células [[ritmo|rítmicas]] bastante rápidas e complexas.
Os bongôs são utilizados principalmente na música do [[caribe]],tal- como a [[rumba]], [[salsa]], [[merengue]]. Nestes ritmos normalmente é tocado junto com as [[conga]]s e as [[tumbadora]]s. O padrão básico do bongô é o chamado ''martillo'' (Martelo'martelo' em castelhano) que marca o primeiro e terceiro tempos sobre o ''macho'' e o quarto tempo sobre a ''hembra''. As mãos se alternam,: a direita marca os tempos, e a esquerda preenche os espaços com variações rítmicas que permitempodem executar variaçõesser bastante criativas, sem nunca deixar o papel de sustentaçãosustentar deo ritmo.
Em uma orquestra tradicional, o bongocerro''bongosero'' possui duas funções. Durante a introdução, os versos e os solos de dinâmica baixa, ele toca o bongô. Quando a música cresce, pelosendo fato doo bongô ser um instrumento de volume sonoro inferior aosao outrosdos demais, o bongocerro''bongosero'' troca de instrumento, passando a tocar a Campana[[campana (instrumento musical)|campana]] (uma espécie de [[cow-bell]],''cowbell''; em espagnolespanol, ''cencerro'').
