Ele se casou com sua namorada de longa data, em 1996. Em abril de 1997, eles tiveram uma filha, Estelle Desire (seu apelido para ela é "Hero" (herói)). Mais tarde o casal se separou. Mike se casou novamente em 2004, mas se divorciou novamente no mesmo ano. Casou-se no dia 14 de março de 2009 com Brittney Cade, com quem teve um filho nascido no dia 11 de outubro de 2008, chamado Brixton Michael. Após ter Brixton, o casal deu à luz Ryan Ruby Mae no dia 29 de Novembro de 2010. Em dezembro de 2015, Dirnt junto com Billie Joe Armstrong, anunciou que iria lançar uma empresa de café, [[Oakland Coffee]]. A empresa vai vender grãos de café orgânicos e diz-se ser a primeira empresa a utilizar sacos e vagens exclusivamente 100% compostáveis.
