Diferenças entre edições de "AutoDock"

71 bytes adicionados ,  22h51min de 6 de abril de 2016
sem resumo de edição
(nova página: {{em tradução}} '''AutoDock''' é um software de simulação de modelagem molecular. É especialmente eficaz para docagem de proteína-ligando. AutoDock 4 está disponíve...)
 
 
===Programas===
AutoDock consistsconsiste ofde twodois mainprogramas programsprincipais:
* AutoDock para docagem do ligando a um conjunto de grades que descrevem a proteína alvo;
* AutoGrid para pré-cálculo dessas grades.
 
O AutoDock tem uma versão melhorada, o [[AutoDock Vina]] que tem uma melhor rotina de busca local e faz uso de configurações de computador para múltiplos núcleos/multi-CPUs<ref>{{citation |author=Trott, O.; Olson, A.J. |year=2010 |title=AutoDock Vina: Improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization, and multithreading |journal=Journal of Computational Chemistry |volume=31 |issue=2 |pages=455-461 |url=http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jcc.21334/abstract |doi=10.1002/jcc.21334}}</ref>.
<!--
Usage of AutoDock has contributed to the discovery of several drugs, including HIV1 integrase inhibitors.
 
O uso do AutoDock tem contribuído para a descoberta de vários fármacos, incluindo inibidores da integrase do HIV-1.
===Third party improvements===
 
As an open source project, AutoDock has gained several third party improved versions such as:
===Melhorias de terceiros===
* GPU improved calculation routines
Como um projeto open source, o AutoDock tem obtido várias versões melhoradas por terceiros, tais como:
* SSE improved calculation routines
* Rotinas de cálculo para GPU melhoradas
* Integration within bigger projects: OFF-TARGET PIPELINE https://sites.google.com/site/offtargetpipeline
* Rotinas de cálculo para SSE melhoradas
* IntegrationIntegração withinno biggerâmbito projectsdos projetos de maior dimensão: ''OFF-TARGET PIPELINE'' https://sites.google.com/site/offtargetpipeline
<!--
* Rescoring of AutoDock Vina poses with multiple scoring functions and calibration of Consensus Scoring equations: CONSENSUS SCORING TOOLKIT http://consscortk.molsim.pharm.uoa.gr/