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A urina é semeada em meios de cultura apropriados para o isolamento de bactérias [[Gram-positivas]] e [[Gram-negativas]], excluídas as bactérias anaeróbicas que não são usualmente pesquisadas<ref name="Sherri">Ryan, K. J. (ed), ''Sherri's Microbiology - An Introduction to Infectious Diseases.'' Connecticyt, USA: Appleton & Lange, thrid edition. 1994. ISBN 0-8385-8542-6.></ref> ; Em uma segunda etapa do exame, as bactérias que cresceram na etapa de isolamento são incubadas em meios adequados para a determinação da sua espécie (Identificação) e susceptibilidade a antimicrobianos, o chamado ''antibiograma''. Estes resultados representam importantes guias para o médico na condução do tratamento, e, coletivamente, para avaliações epidemiológicas.
 
infecções do trato urinario
===Urina de primeiro jato===
A ''urina de primeiro jato'' é colhida quando se deseja pesquisar parasitas eventualmente presentes na uretra<ref name="Henry" />. Dentre estes os principais são o ''[[Trichomonas vaginalis]]'' (protozoário) e a ''[[Neisseria gonorrhoeae]]'' (bactéria). após a higiene dos genitais externos, colhe-se em frasco apropriado (estéril) apenas o primeiro jato da micção. Este jato leva consigo os micro-organismos que porventura se encontrem presentes na uretra. A urina assim colhida pode ser concentrada e observada à microscopia ou cultivada.