Os motivos de sua saída de Florença permanecem um tanto obscuros, mas há uma hipótese que Filippo teria caído em desgraça ao participar de uma fracassada conspiração para derrubar [[Cosmo I, Grão-Duque da Toscana|Cosme de Médici]], razão pela qual teria buscado refúgio em Portugal, partindo posteriormente para o Brasil. A documentação disponível, nos mostra que [[Cosmo I, Grão-Duque da Toscana|Cosme de Médici]] escreveu e assinou o atestado de nobreza de Filipo que o permitiu receber uma condecoração do rei de Portugal em 1558, o que contrasta com essa versão.<ref>[http://www.buratto.net/doria/Cavalcanti.html Carta ao duque de Florença, Cosimo de' Medici, solicitando-lhe que certificasse a nobreza de Filippo Cavalcanti, para que este pudesse receber uma condecoração do rei de Portugal, em [[1558]].]</ref> Ademais, o pai de Filippo, Giovanni di Lorenzo di Filippo Cavalcanti, grande mercador florentino, era um partidário dos Médici muito próximo do [[Papa Leão X]] (nascido Giovanni di Lorenzo de' Medici), e atuava como elemento de ligação entre a [[Cúria]] e a corte de [[Henrique VIII]], com uma função diplomática, misturada a atividades comerciais e bancárias, junto com Pierfrancesco de' Bardi.<ref>[http://www3.interscience.wiley.com/journal/118950362/abstract ''"Consumption and trade of art between Italy and England in the first half of the sixteenth century: the London house of the Bardi and Cavalcanti company"'', por Cinzia M. Sicca]</ref> O fato de [[Henrique VIII]] ter adicionado uma asna de azul carregada de um leonel de ouro no seu ápice entre duas flores de lis do mesmo ao brasão da família, faz perceber que Giovanni tinha alguma importância para o Rei.
De antiga família [[guelfos|guelfa]] de Florença, filho do mercador Giovanni di Lorenzo di Filippo Cavalcanti e de Ginevra Manneli foi batizado na [[Basílica da Santa Cruz|Santa Croce]], segundo a documentação subsistente.
