Duchovny, começou a estudar no [[Grace Church School]] e frequentou o liceu [[The Collegiate School]], ambos em [[Manhattan]]. [[graduação|Graduou-se]] (''Bachelor of Arts'' - BA) pela [[Universidade Princeton]] em 1982 em [[literatura inglesa]].<ref name="actors"/> Em 1982 a sua poesia recebeu uma menção honrosa pela [[Academy of American Poets]]. O título da sua tese foi ''The Schizophrenic Critique of Pure Reason in [[Samuel Beckett|Beckett]]'s Early Novels''.<ref name="thesis">{{citar web |autor=Duchovny, David William |url=http://libweb5.princeton.edu/theses/index.htm |publicado=Libweb5.princeton.edu |título=The Schizophrenic Critique of Pure Reason in Beckett's Early Novels |data= |acessodata= |língua= inglês |obra=1982}}</ref> Obteve o mestrado (''Master of Art''s - MA) também em literatura inglesa na [[Universidade Yale|Universidade de Yale]] e subsequentemente iniciou o doutoramento com base na tese ''Magic and Technology in Contemporary Poetry and Prose'' que no entanto até ao momento, se mantém inacabado.<ref name="actors"/>
