Alagoinhas possui 151152 [[escola]]s, sendo 87 municipais, 29 estaduais, 1 federal e 35 particulares; e 12 instituições de [[ensino superior]] autorizadas pelo MEC. São destaques na rede municipal o [[Colégio Municipal de Alagoinhas]], na rede estadual, o [[Colégio Modelo Luis Eduardo Magalhães]], Colégio Estadual Deputado Luís Eduardo Magalhães (no Barreiro),o [[CETEP (Bahia)|CETEP]] (Centro Territorial de Educação Profissional), [[colégio da policia militar professor Calos Rosa|Colégio da Polícia Militar Professor Carlos Rosa]] e o Colégio Estadual São Francisco . O campus do IF BAIANO, inaugurado em 2016, é uma unidade da Rede Federal de Educação Profissional e Tecnológica que, em sua plena capacidade de funcionamento, ofertará cursos profissionalizantes desde a formação básica (ensino médio) até a especialização (pós-graduação). Na rede privada, têm-se como destaques o Colégio Dínamo, Colégio Star, Colégio Santíssimo Sacramento, Colégio São Francisco das Irmãs Franciscanas e o Centro Educacional Cenecista Alcindo de Camargo.{{carece de fontes|data=janeiro de 2016}}
Em [[2012]], após a divulgação dos índices do [[Ideb]] 2011, Alagoinhas ganhou destaque no noticiário [[nacional]]. Com nota 2.8, Alagoinhas não conseguiu atingir a [[meta]] de 3.0 imposta pelo [[MEC]] para 2011.<ref>http://ideb.inep.gov.br/resultado/resultado/resultado.seam?cid=1403040</ref>
