Clustal: diferenças entre revisões
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| linguagem = [[C (linguagem de programação)|C]]
| data_lancamento =
| ultima_versao = 2.1
| ultima_data = {{data de lançamento|ano=2010|mês=11|dia=17}}
| versao_beta =
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'''Clustal''' é um programa de computador para [[alinhamento múltiplo de sequências]] amplamente usado.<ref name="Chenna2003">{{citar jornal |doi=10.1093/nar/gkg500 |autor=Chenna R, Sugawara H, Koike T, Lopez R, Gibson TJ, Higgins DG, Thompson JD |título=Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs |jornal=Nucleic Acids Res |volume=31 |número=13 |página=3497–3500 |ano=2003 |pmid=12824352 |pmc=168907}}</ref> Sua versão mais recente é a 2.1.<ref name="Larkin2007">{{citar jornal |autor=Larkin MA, Blackshields G, Brown NP, Chenna R, McGettigan PA, McWilliam H, Valentin F, Wallace IM, Wilm A, Lopez R, Thompson JD, Gibson TJ, Higgins DG |título=ClustalW and ClustalX version 2 |jornal=Bioinformatics |volume=23 |número=21 |página=2947–2948 |ano=2007 |pmid=17846036 |doi=10.1093/bioinformatics/btm404}}</ref> Existem duas variações principais:
*'''ClustalW''': interface de linha de comandos
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== Alinhamento múltiplo de sequências ==
Há três etapas principais:<br/>
#Fazer um [[
#Criar uma [[árvore filogenética]] (ou usar uma árvore definida-por-usuário)
#Usar a árvore filogenética para realizar um alinhamento múltiplo
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Os principais parâmetros são a penalidade de lacuna aberta (gap opening penalty) e a penalidade por extensão de lacuna (gap extension penalty).
==
* [[PHYLIP]]
* [[MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis]]
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* [[Filogenética]]
==
*[http://www.clustal.org Clustal Homepage] (Unix/Linux, Mac, and Windows download livre)
*[http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html ClustalW e ClustalX mirror no EBI] (Unix/Linux, Mac, and Windows download livre)
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