Protein Data Bank: diferenças entre revisões
Conteúdo apagado Conteúdo adicionado
→Átomos: Inseri um exemplo de arquivo. Futuramente farei mais alterações. |
adicionei um metodo para coleta de sequencias usando a linguagem de programação python... em breve adicionarei mais métodos... |
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Linha 38:
ATOM 1047 O ALA A 134 37.642 -3.085 -6.812 1.00 18.58 O
END
</syntaxhighlight><br />
== Coleta de dados usando Python ==
<syntaxhighlight lang="python3">
arquivo_pdb = open("nome_arquivo.pdb")
linhas = arquivo_pdb.readlines()
for linha in linhas:
# tipo da linha (ex. ATOM)
tipo = linha[0:6].strip()
# informacoes de atomos
atomo_id = linha[6:11].strip()
atomo_nome = linha[11:16].strip()
# informacoes de residuoes
residuo_nome = linha[17:20].strip()
cadeia = linha[21:22].strip()
residuo_id = linha[22:26].strip()
# coordenadas
x = linha[30:38].strip()
y = linha[38:46].strip()
z = linha[46:54].strip()
</syntaxhighlight>
== {{Ligações externas}} ==
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