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Enquanto estava estudando de maneira intensiva sobre transmutação, Darwin começou a ficar obcecado em trabalhar com suas pesquisas. Não deixando de reescrever seus diários, ele os editou e publicou em periódicos especializados, e com a ajuda de Henslow obteve um fundo de £1,000 para publicar seu compilado em um multi-volume denominado ''[[Zoology of Voyage of H.M.S Beagle]]'', uma quantia equivalente a £83,000 em 2016. Ele planejou que com essa quantidade conseguiria publicar livros sobre geologia que acabaram tendo datas de lançamento irreais entre o prometido entre os editores.<ref>{{Harvnb|Browne|1995|pp=367–369}}</ref> No início da [[Era Vitoriana]], Darwin se apressou em terminar seus diários, e em agosto de 1837 já estava corrigindo preliminares.<ref>{{harvnb|Keynes|2001|p=[http://darwin-online.org.uk/content/frameset?viewtype=text&itemID=F1925&pageseq=21 xix]}}</ref>
 
O excesso de preocupação afetou a saúde de Darwin. Em 20 de setembro ele apresentou "uma palpitação inconfortável no coração", e seu médico recomendou de imediato a interrupção do trabalho e férias por algumas semanas. Após visitar Shrewsbury ele encontrou parentes em [[Maer Hall]], [[Staffordshire]], mas o interesse em excesso deles por suas viagens o desgastou. A encantadora, inteligente e culta prima Emma Wedgwood, nove meses mais velha que Darwin, estava trabalhando como enfermeira da tia invalidainválida. O tio Josiah mostrou uma área do solo onde restos de cinzas tinham desaparecido e sugeriu ser a ação de [[minhoca]]s, inspirando uma "nova e importante teoria" na formação dos solos, a qual Darwin apresentou na ''Geological Society'' em 1 de novembro.<ref>{{Harvnb|Desmond|Moore|1991|pp= 233–234}}<br />{{cite web|url=http://www.darwinproject.ac.uk/darwinletters/calendar/entry-404.html|title=Darwin Correspondence Project&nbsp;– Letter 404&nbsp;– Buckland, William to Geological Society of London, 9 Mar 1838|accessdate=23 de dezembro de 2008|deadurl=no|archiveurl=https://web.archive.org/web/20090629192234/http://www.darwinproject.ac.uk/darwinletters/calendar/entry-404.html|archivedate=29 de junho de 2009|df=dmy-all}}</ref>
 
[[William Whewell]] encaminhou Darwin para a secretaria da ''Geological Society''. Inicialmente ele recusou o trabalho mas aceitou em 1838.<ref>{{Harvnb|Desmond|Moore|1991|pp= 233–236}}.</ref> Apesar da atenção necessária com seus diários no processo de edita-los, Darwin conseguiu fazer grandes avanços na área de transmutação, usando cada oportunidade que tinha para interrogar naturalistas experientes e, de maneira não conveniente, indivíduos com experiência prática tais como fazendeiros e criadores de porcos.<ref name=JvW /><ref>{{Harvnb|Desmond|Moore|1991|pp= 241–244, 426}}</ref> Ao longo do tempo, ele conseguiu estender suas análises até mesmo com seus filhos e família, parentes relacionados, vizinhos, [[colonialista]]s e ex-colegas do Beagle.<ref>{{Harvnb|Browne|1995|p=xii}}</ref> Darwin então incluiu pesquisas de aspecto humano no escopo de suas especulações, e ao ver um [[orangotango]] no zoológico em 28 de março de 1838, fez comparações de seu comportamento similarmente infantil a crianças.<ref>{{Harvnb|Desmond|Moore|1991|pp= 241–244}}</ref>