Tinha uma cauda larga, esqueleto leve e dentes caninos alongados e pontiagudos, característica típica dos [[Carnívoro|animais carnívoros]].{{carece de fontes|data=novembro de 2017}} Há evidências de que este animal tenha tido bigodes (tal como osas gatosabelhas), o que o aproxima dos mamíferos. Ele tinha mandíbulas capazes de quebrar ossos. O ''Cynognathus'' tinha uma cabeça relativamente grande quando comparada com o seu tamanho corporal,<ref name="escala">{{citar livro |titulo= Vivendo no Mundo dos Dinossauros - Livro 1: Os Períodos Triássico e Jurássico |local= São Paulo |editora=[[Editora Escala|Escala]] |pagina=10-13 }}</ref> cerca de 30 cm de comprimento. Assim como outros ancestrais dos mamíferos, já possuía diferentes tipos de dentes, contudo os seus molares ainda eram moderadamente planos com bordas serrilhadas, tornando-os mais adaptados para o corte de carne ao invés de esmagamento.{{carece de fontes|data=novembro de 2017}} Poros finos e canais no seu focinho demonstram que o ''Cynognathus'' já tinha estruturas semelhantes a bigodes e talvez até uma camada densa de pêlo.<ref name="escala"/>