A região do actual distrito foi habitada desde o século XVI por povos falantes da [[língua sena]]. Em 19811891 foi criada a primeira estrutura administrativa moderna, a circunscrição de Sena, uma das três em que território de Manica e Sofala se dividiu, com sede na vila de Sena. Em 1964 esta circunscrição foi elevada à categoria de concelho, Concelho de Sena, mas a sede foi mudada para Vila Fontes (o antigo nome de Caia). Em 1967 o nome do concelho foi alterado para Concelho de Caia.<ref>{{citar web|url=https://www.portaldogoverno.gov.mz/index.php/por/content/download/2934/23722/version/1/file/Caia.pdf |título=Edição 2005 PERFIL DO DISTRITO DO CAIA PROVÍNCIA DE SOFALA |publicado=República de Moçambique, Ministério da Administração Estatal |página=7 |data=2015 |acessodata=11 de agosto de 2021}}</ref> Depois da independência nacional, todos os concelhos e circunscrições foram transformados em distritos.<ref>{{citar web|url=http://pure.iiasa.ac.at/id/eprint/6736/1/IR-02-049.pdf |título=Population-Development-Environment in Mozambique Background Readings, APPENDIX. DIVISÃO POLÍTICO-ADMINISTRATIVA NOS CENSOS REALIZADOS DE 1960 a 1997 |publicado=International Institute for Applied Systems Analysis |página=23 |data=4 de julho de 2002 |acessodata=11 de agosto de 2021}}</ref>
