Variante Gama do SARS-CoV-2

variante isolada do SARS-CoV-2

A linhagem P.1 ou variante Gama é uma das variantes do SARS-CoV-2, o vírus causador do COVID-19.[1] Esta variante do SARS-CoV-2 foi chamada de linhagem P.1 e tem 17 alterações exclusivas de aminoácidos, 10 das quais na sua proteína de pico, incluindo N501Y e E484K .[2] Esta variante do SARS-CoV-2 foi detectada pela primeira vez pelo Instituto Nacional de Doenças Infecciosas (NIID), no Japão, no dia 6 de janeiro de 2021 em quatro pessoas que chegaram a Tóquio depois de visitar a região do Amazonas, no Brasil, quatro dias antes.[3] Posteriormente, foi declarada como estando em circulação no Brasil.

Variante Gama do SARS-CoV-2
Variante da SARS-CoV-2 vírus responsável pela COVID-19 e sua pandemia
Nome científico P1
Apelido Variante Gamma
Primeira detecção em  Brasil
Variante de Preocupação (VOC)? Sim
Variante de Interesse (VOI)? Sim
Resistencia á vacinação Sem indícios
Dados expostos no mapa é de 21 de Abril 2021

Provocou infecção generalizada na cidade de Manaus, apesar de a cidade já ter passado por uma infecção generalizada em maio[4] com um estudo[5] indicando alta soroprevalência de anticorpos para SARS-CoV-2.[6] P.1 também foi chamada de 'B.1.1.28.1',[7] embora estritamente apenas três subníveis sejam permitidos no sistema de nomenclatura da linhagem PANGO, daí a designação 'P.1'.[8]

Pesquisa editar

Em 12 de janeiro de 2021, o Centro CADDE Brasil-Reino Unido confirmou 13 casos locais da linhagem P.1 em Manaus, estado do Amazonas, a maior cidade da floresta amazónica.[8] A nova linhagem esteve ausente nas amostras de março a novembro de Manaus, mas foi identificada em 42% das amostras de dezembro de 2020 coletadas na mesma cidade, sugerindo um aumento recente na frequência.[9]

Uma pré-publicação de um artigo de Carolina M Voloch et al. descreve as relações entre amostras brasileiras sequenciadas durante 2020 e identificou uma nova linhagem de SARS-CoV-2, 'B.1.1.248', em circulação no Brasil, que se originou a partir da B.1.1.28. É descrita como emergindo pela primeira vez em julho e detectado por eles mesmos em outubro, mas a partir da publicação (dezembro de 2020), embora tenha aumentado significativamente em frequência, ainda estava amplamente (61% dos casos) confinada à capital do estado do Rio de Janeiro .[10] Em maio, a maioria das suas amostras foram da linhagem B.1.1.33, enquanto em setembro houve uma disseminação significativa da B.1.1.28, e durante outubro e novembro a P.1 predominou sobre, respectivamente, 3 e 4 outras classificações usando a ferramenta Pangolin.[11] O artigo identifica a alteração E484K (presente em B.1.1.28 e P.1) como "amplamente difundida" nas amostras (por exemplo, 36 das 38 amostras num conjunto).

Ver também editar

Referências

  1. Third concerning coronavirus variant should be a 'wake up call' to the world, experts warn 12 January 2021 www.telegraph.co.uk, accessed 17 January 2021
  2. COG-UK Report on SARS-CoV-2 Spike mutations of interest in the UK www.cogconsortium.uk, Accessed 25 January 2021
  3. «Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil». Japan Today. Japan. 11 de janeiro de 2021. Consultado em 14 de janeiro de 2021 
  4. Matt Rivers. «Is a new coronavirus variant to blame for this Brazilian city's collapse?». CNN. Consultado em 31 de janeiro de 2021 
  5. Buss, Lewis F.; Prete, Carlos A.; Abrahim, Claudia M. M.; Mendrone, Alfredo; Salomon, Tassila; de Almeida-Neto, Cesar; França, Rafael F. O.; Belotti, Maria C.; Carvalho, Maria P. S. S.; et al. (8 de dezembro de 2020). «Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic». American Association for the Advancement of Science. Science. 371: 288–292. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.abe9728  
  6. Sabino, Ester C.; Buss, Lewis F.; Carvalho, Maria P. S.; Prete, Carlos A.; Crispim, Myuki A. E.; Fraiji, Nelson A.; Pereira, Rafael H. M.; Parag, Kris V.; Peixoto, Pedro da Silva (27 de janeiro de 2021). «Resurgence of COVID-19 in Manaus, Brazil, despite high seroprevalence». The Lancet (em English). 0. ISSN 0140-6736. doi:10.1016/S0140-6736(21)00183-5  
  7. Marlúcia Seixas (25 de janeiro de 2021). «Fiocruz Amazon confirms reinfection by a new variation of the Sars-CoV-2». Fiocruz Amazon. Fiocruz, Oswaldo Cruz Foundation 
  8. a b Faria, Nuno R.; et al. (12 de janeiro de 2021). «Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings». Virological (em inglês). Consultado em 23 de janeiro de 2021 
  9. Danner, Chas (25 de janeiro de 2021). «What We Know About the New P.1 Strain of the Coronavirus». nymag.com. Consultado em 28 de janeiro de 2021 
  10. Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil (Abstract) Carolina M Voloch et al. via www.medrxiv.org, accessed 15 January 2021 doi.org/10.1101/2020.12.23.20248598
  11. Voloch, Carolina M.; et al. (2020). "Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil". Figure 5. Retrieved 15 January 2021. doi:10.1101/2020.12.23.20248598 – via MedRxiv.