Também em 1990, na reinauguraçãovolta doda GPFórmula 1 ao Autódromo de Interlagos, - que contara agora com ao novo S do Senna entree outras modificações, significativas no circuito - frustrou milhões de expectadores brasileiros quando envolveu-se em um acidente com Ayrton Senna. O piloto brasileiro vinha liderando com folga, quando Nakajima, como retardatário, cortou Senna,comodurante retardatáriouma manobra de ultrapassagem na freiada do bico de pato. O choque forçou Ayrton Senna a trocar o bico do carro nos boxes, perdendo pelo menos 40 segundos em pista, caindo para a terceira posição e deixando a vitória para seu rival (e algoz de 1989) Alan Prost. A primeira vitória de Ayrton Senna no Brasil seria adiada para 1991.
