A ANP é conduzida por uma diretoria colegiada,composta de um diretor-geral e quatro diretores com mandatos de quatro anos não coincidentes. Sessões deliberativas da diretoria emitem portarias, resoluções e instruções normativas para as indústrias reguladas e podem resolver pendências entre agentes econômicos e entre esses agentes e os consumidores. Todas as decisões são publicadas na internet, no endereço [http://www.anp.gov.br www.anp.gov.br]. A ANP também realiza audiências públicas antes de tomar qualquer decisão sobre normas que possam afetar direitos.