O protagonista do jogo é Shay Patrick Cormac, um recruta de 24 anos da Ordem dos Assassinos, que cresce desiludido com os métodos e a causa da Ordem, mesmo quando a sua carreira começa a dar os primeiros passos.<ref name="ShayProfile" /> Eventualmente, ele é traído e abandonado pelos Assassinos, depois deApós um trabalho em [[Lisboa]] acabar em desastre, Shay se revolta contra o então mestre assassino Achilles, e após um confronto Shay supostamente morre.<ref name="ShayProfile" /><ref name="Polygon1" /><ref>{{citar web|URL=http://www.eurogamer.net/articles/2014-10-15-assassins-creed-rogue-is-more-than-the-cash-grab-it-could-have-been|título=Assassin's Creed: Rogue is more than the cash-grab it could have been|autor=Tom Phillips|data=16-10-2014|publicado=[[Eurogamer]]|acessodata=16-10-2014}}</ref><ref>{{citar web|URL=http://www.gamereactor.pt/noticias/57394/Lisboa+aparece+em+Assassin's+Creed%3A+Rogue/|título=Lisboa aparece em Assassin's Creed: Rogue|autor=Ricardo C. Esteves|data=16-10-2014|publicado=GameReactor|acessodata=17-10-2014}}</ref> DesteCom modo,o tempo as novas amizades o levam a juntajuntar-se aos Templários, oferecendo os seus serviços como Caçador de Assassinos para conseguir ter uma oportunidade de vingança.<ref name="Polygon1" /><ref name="lançamento" /><ref name="VG247" /> As acções de Cormac irão ter consequências no futuro da Irmandade.<ref name="Polygon1" /><ref name="VG247" /> Cormac tem ligações aos eventos que ocorrem em ''[[Assassin's Creed Unity]]''.<ref name="GICoverStory">{{citar web|url=http://www.gameinformer.com/b/news/archive/2014/08/05/september-cover-reveal-assassins-creed-rogue-unity.aspx|titulo=September Cover Revealed – Assassin's Creed Rogue And Unity|autor=Wallace, Kimberly|publicado=GameStop|trabalho=[[Game Informer]]|data=5-8-2014|acessodata=5-8-2014}}</ref> Haytham Kenway - antagonista secundário e jogável por um período em ''[[Assassin's Creed III]]'' - aparecerá no jogo,<ref name="IGNHandsOn" /> bem como Achilles Davenport, mentor de [[Assassin's Creed III|Ratonhnhaké:ton]], e Adéwalé, companheiro de Edward Kenway em ''[[Assassin's Creed IV: Black Flag|Black Flag]]'', e o protagonista de ''[[Assassin's Creed IV: Black Flag#Conteúdo adicional|Freedom Cry]]''.<ref>{{citar web|URL=http://www.gameinformer.com/games/assassins_creed_rogue/b/ps3/archive/2014/09/05/see-the-assassin-hunter-in-action-in-new-trailer.aspx|título=See The Assassin Hunter In Action In New Trailer|autor=Jeff Cork|data=5-9-2014|trabalho=[[Game Informer]]|acessodata=25-9-2014}}</ref>
''Rogue'' decorre entre 1752 e 1761 durante o [[Guerra Franco-Indígena|conflito Franco-Indígena]], um dos palcos da [[Guerra dos Sete Anos]], e tem lugar em várias localizações da [[América do Norte]], incluindo o [[Atlântico Norte]], o [[Apalaches|Grande Vale Apalache]], [[Alabama]], [[Quebeque]] e [[Nova Iorque]].<ref name="ShayProfile" /><ref name="Polygon1" /><ref name="VG247" />
