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São raros nas [[plantae|plantas]], mas ocorrem, por exemplo, nas [[cicadácea]]s. Os [[protozoário]]s com cílios (por exemplo, do filo [[Ciliophora]] ou [[ciliado]]s) usam-nos na [[locomoção]] ou simplesmente para moverem o líquido em que se encontram.
O [[ser humano]] e os outros [[mamífero]]s têm células ciliadas no revestimento interno da [[traqueia]] e [[brônquios]], que servem para reter [[muco]] e poeira que poderiam prejudicar os [[pulmão|pulmões]], e também nos [[oviduto]]s, onde eles ajudam o [[óvulo]] a mover-se do [[ovário]] para
Em alguns tecidos, os cílios podem ter função sensorial e até sofrer modificações em sua estrutura. Estes cílios sensoriais são denominados quinocílios e são exemplos de sua ocorrência o epitélio sensorial da mucosa olfativa, o epitélio da retina e aqueles associados com as funções de equilíbrio e audição no [[ouvido interno]], [[mácula lútea|máculas]] e [[órgão de Corti]], respectivamente.
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