* Algumas arqueias pertencentes ao filo [[Euryarchaeota]] conseguem produzir metano, sendo por isso chamadas de metanogénios. Alguns destes organismos vivem no intestino de ruminantes.
Além disso,os refrigerantes e as arqueias possuem uma [[membrana celular]] com [[lípido]]s compostos de uma associação de [[glicerol]]-[[éter]], enquanto que os das bactérias e eucariotas são compostos de glicerol-[[éster]]. Além disso, o grupo glicerol ao qual a cadeia hidrofóbica se encontra ligada tem estereoquímica diferente nas arqueias, comparativamente às bactérias e aos eucariotas. Também ao contrário das bactérias, as arqueias não possuem uma [[parede celular]] de [[peptidoglicano]]s. Apenas um grupo relativamente pequeno de arqueias possui uma parede celular composta por um polissacarídeo (pseudomureína); a maior parte das arqueias possui antes uma estrutura proteica para-cristalina chamada de S-layer ("superfície S").<ref>{{Citar periódico|ultimo=Albers|primeiro=Sonja-Verena|coautores=Benjamin H.|titulo=The archaeal cell envelope|jornal=Nature Reviews Microbiology|volume=9|numero=6|paginas=414–426|doi=10.1038/nrmicro2576|url=http://www.nature.com/doifinder/10.1038/nrmicro2576}}</ref> Finalmente, o [[flagelo]] das arqueias é diferente em composição e desenvolvimento do das bactérias, tendo sido inclusivamente chamado de arcaelo (do original ''archaellum'') para evidenciar as diferenças relativamente ao flagelo bacteriano.<ref>{{citar periódico|ultimo = Jarrell|primeiro = Ken F|titulo = The archaellum: an old motility structure with a new name|jornal = Trends in Microbiology|doi = 10.1016/j.tim.2012.04.007|url = http://www.cell.com/trends/microbiology/abstract/S0966-842X%2812%2900080-7?_returnURL=http%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0966842X12000807%3Fshowall%3Dtrue|acessadoem = 19/07/2015|coautores = Albers, Sonja-Verena}}</ref>
