Archaea: diferenças entre revisões
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O conhecimento actual sobre a diversidade dos archaea é fragmentário e o número total de espécies de archaea não pode ser estimado com precisão.<ref name=Robertson>{{citar periódico|autor =Robertson CE, Harris JK, Spear JR, Pace NR |título=Phylogenetic diversity and ecology of environmental Archaea |periódico=Curr. Opin. Microbiol. |volume=8 |número=6 |páginas=638–42 |ano=2005 |pmid=16236543}}</ref> Mesmo estimativas do número total de filos nos archaeae variam entre 18 a 23, dos quais apenas 8 filos possuem representantes que foram cultivados e estudados directamente. Muitos destes grupos hipotéticos são conhecidos somente através de uma simples sequência de ARNr, indicando que a vasta maioria da diversidade entre estes organismos permanece completamente desconhecida.<ref>{{citar periódico|autor =Hugenholtz P |título=Exploring prokaryotic diversity in the genomic era |periódico=Genome Biol. |volume=3 |número=2 |páginas=REVIEWS0003 |ano=2002 |pmid=11864374 |url=http://genomebiology.com/1465-6906/3/REVIEWS0003 |doi =10.1186/gb-2002-3-2-reviews0003 }}</ref> O problema de como estudar e classificar micróbios não cultivados, ocorre também em Bacteria.<ref>{{citar periódico|autor =Rappé MS, Giovannoni SJ |título=The uncultured microbial majority |periódico=Annu. Rev. Microbiol. |volume=57 |páginas=369–94 |ano=2003 |pmid=14527284 |doi=10.1146/annurev.micro.57.030502.090759}}</ref>
==== Espécies ====
A classificação das arqueias em espécies é também controversa. Em [[biologia]], define-se [[espécie]] como um grupo de organismos relacionados. O critério de que se podem reproduzir entre si e não com outros, que se pode aplicar com relativa facilidade a animais ou plantas, não se aplica às arqueias, que se reproduzem assexuadamente.<ref name="de Queiroz">{{citar periódico |autor=de Queiroz K |título=Ernst Mayr and the modern concept of species |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |volume=102 |número=Suppl 1 |páginas=6600–7 |ano=2005 |pmid=15851674 |url=http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15851674 |doi =10.1073/pnas.0502030102 |pmc=1131873|bibcode = 2005PNAS..102.6600D }}</ref>
Além disso, as Archaea apresentam um alto grau de [[transfêrencia horizontal de genes]] entre distintas linhagens. Alguns investigadores sugerem que os indivíduos podem agrupar-se em povoações semelhantes a espécies quando se observa uma grande similaridade dos seus [[genoma]]s e uma pouco frequente transferência de genes a/de células que tenham genomas menos relacionados, como no caso do género ''[[Ferroplasma]]''.<ref>{{
citar periódico |autor=Eppley JM, Tyson GW, Getz WM, Banfield JF |título=Genetic exchange across a species boundary in the archaeal genus ferroplasma |revista=Genetics |volume=177 |número=1 |páginas=407–16 |ano=2007 |pmid=17603112 |url=http://www.genetics.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=17603112 |doi =10.1534/genetics.107.072892 |pmc=2013692}}</ref> Por outro lado, em estudos do género ''[[Halorubrum]]'' encontrou-se uma significativa transferência de genes a/doutras povoações menos relacionadas, o que limita a aplicabilidade deste critério.<ref>{{citar periódico |autor=Papke RT, Zhaxybayeva O, Feil EJ, Sommerfeld K, Muise D, Doolittle WF |título=Searching for species in haloarchaea |revista=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |volume=104 |número=35 |páginas=14092–7 |ano=2007 |pmid=17715057 |url=http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=17715057 |doi =10.1073/pnas.0706358104 |pmc=1955782 |bibcode = 2007PNAS..10414092P }}</ref> Uma segunda preocupação está em que medida essas designações de espécies apresentam um significado práctico.<ref>{{citar periódico |autor=Kunin V, Goldovsky L, Darzentas N, Ouzounis CA |título=The net of life: reconstructing the microbial phylogenetic network |revista=Genome Res. |volume=15 |número=7 |páginas=954–9 |ano=2005 |pmid=15965028 |url=http://www.genome.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15965028 |doi =10.1101/gr.3666505 |pmc=1172039}}</ref>
Os conhecimentos que se têm da sua [[diversidade genética]] são fragmentários e o número total de espécies de arqueias não pode ser estimado com precisão.<ref name=Robertson>{{citar periódico |autor=Robertson CE, Harris JK, Spear JR, Pace NR |título=Phylogenetic diversity and ecology of environmental Archaea |revista=Curr. Opin. Microbiol. |volume=8 |número=6 |páginas=638–42 |ano=2005 |pmid=16236543 |doi=10.1016/j.mib.2005.10.003}}</ref> A estimativa dos possíveis filos que poderia haver (quase todos sem terem sido descritos) é de entre 18 e 23, dos quais só 8 possuem representantes que sejam cultivados e estudados directamente (na LPSN figuram 5 filos). Muitos destes grupos hipotéticos só são conhecidos por uma só sequência de ARNr, o que indica que a diversidade entre estes organismos mantém-se pouco clara.<ref>{{cita publicación periódica |autor=Hugenholtz P |título=Exploring prokaryotic diversity in the genomic era |revista=Genome Biol. |volume=3 |número=2 |páginas=REVIEWS0003 |ano=2002 |pmid=11864374 |url=http://genomebiology.com/1465-6906/3/REVIEWS0003 |doi =10.1186/gb-2002-3-2-reviews0003 |pmc=139013 }}</ref> Entre as bactérias também existem muitos micróbios não cultivados com implicações parecidas para a sua caracterização.<ref>{{citar periódico |autor=Rappé MS, Giovannoni SJ |título=The uncultured microbial majority |revista=Annu. Rev. Microbiol. |volume=57 |páginas=369–94 |ano=2003 |pmid=14527284 |doi=10.1146/annurev.micro.57.030502.090759}}</ref>
== Origem e evolução ==
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