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</ref> resultando na [[Inquisição Espanhola]] e [[Inquisição portuguesa|Portuguesa]]. Esses dois reinos em particular operavam tribunais inquisitoriais ao longo de seus respectivos impérios (o [[Império Espanhol|Espanhol]] e o [[Império Português|Português]]) na [[América]] (resultando na Inquisição Peruana e Mexicana), [[Ásia]] e [[África]].<ref name="Murphy">{{citar livro|título=God's Jury |publicado=Mariner Books - Houghton, Miflin, Harcourt |autor =Murphy, Cullen |ano=2012 |local=New York |páginas=150}}</ref> Um foco particular das inquisições espanhola e portuguesa era [[Conversão religiosa|converter]] forçadamente [[judeus]] e [[muçulmanos]] ao [[catolicismo]], em parte porque esses grupos minoritários eram mais numerosos na [[Espanha]] e em [[Portugal]] do que em muitas outras partes da [[Europa]] e em parte porque muitas vezes eles eram considerados suspeitos devido à suposição de que haviam secretamente voltado a praticar suas religiões anteriores.
Desde o século IXXIX, os historiadores têm gradualmente extraído estatísticas dos registros dos tribunais inquisidores, a partir das quais estimativas foram calculadas ajustando o número registrado de condenações pela taxa média de perda de documentos para cada período de tempo compilado. García Cárcel estima que o número total de pessoas julgadas por tribunais inquisitoriais ao longo da sua história foi de aproximadamente 150 mil, dos quais cerca de três mil foram assassinadas - cerca de dois por cento do número de pessoas que foram a julgamento. Gustav Henningsen e Jaime Contreras estudaram os registros da Inquisição Espanhola, que lista {{formatnum:44674}} casos, dos quais 826 resultaram em execuções e 778 em [[efígie]]s (ou seja, quando um boneco de palha era queimado no lugar da pessoa).<ref>Gustav Henningsen, ''The Database of the Spanish Inquisition. The relaciones de causas project revisited'', in: Heinz Mohnhaupt, Dieter Simon, ''[http://books.google.com/books?id=A_Sdchs7yAkC&hl=pl Vorträge zur Justizforschung]'', Vittorio Klostermann, 1992, pp. 43-85.</ref> William Monter estima mil execuções entre 1530-1630 e 250 entre 1630-1730.<ref>W. Monter, ''Frontiers of Heresy: The Spanish Inquisition from the Basque Lands to Sicily'', Cambridge 2003, p. 53.</ref> Jean-Pierre Dedieu estudou os registros de tribunal de [[Toledo]], que colocou 12 mil pessoas em julgamento.<ref>Jean-Pierre Dedieu, ''Los Cuatro Tiempos'', in Bartolomé Benassar, ''Inquisición Española: poder político y control social'', pp. 15-39.</ref> Para o período anterior a 1530, Henry Kamen estimou que houve cerca de duas mil execuções em todos os tribunais da Espanha.<ref>H. Kamen, ''Inkwizycja Hiszpańska'', Warszawa 2005, p. 62; and H. Rawlings, ''The Spanish Inquisition'', Blackwell Publishing 2004, p. 15.</ref> Os [[Tribunal eclesiástico|tribunais eclesiásticos]] atuaram em [[Minas Gerais]] entre 1700 e 1820, onde aconteceram 989 denúncias nas comarcas do [[Comarca do Rio das Mortes|Rio da Mortes]], do [[Comarca do Rio das Velhas|Rio das Velhas]], do [[Comarca do Serro Frio|Serro do Frio]] e na de [[Comarca de Vila Rica|Vila Rica]].<ref>[[#minasgerais|Resende e Souza, 2016]]</ref><ref>{{citar livro|nome=Maria Leônia Chaves de|sobrenome=Resende|nome2=Rafael José de|sobrenome2=Souza|título=Em nome do Santo Ofício: cartografia da Inquisição nas Minas Gerais|local=Belo Horizonte|editora=Fino Traço|ano=2015|isbn=9788580542738}}</ref><ref>{{Citar web|url=http://humanas.blog.scielo.org/blog/2016/03/02/medo-denuncias-e-o-tribunal-do-santo-oficio-no-seculo-xviii|titulo=Medo, denúncias e o Tribunal do Santo Ofício no século XVIII {{!}} SciELO em Perspectiva: Humanas|acessodata=2016-03-02|website=humanas.blog.scielo.org}}</ref>
A instituição da Inquisição persistiu até o início do século XIX (exceto dentro dos Estados Pontifícios), após as [[guerras napoleônicas]] na Europa e depois das guerras hispano-americanas de independência na América. A instituição sobreviveu como parte da [[Cúria Romana]], mas recebeu um novo nome em 1904, de "Suprema Sagrada Congregação do Santo Ofício". Em 1965, tornou-se a [[Congregação para a Doutrina da Fé]].
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