Deinococcota: diferenças entre revisões

[[Cavalier-Smith]] denominou este clado como '''Hadobacteria'''<ref name="Cavalier-Smith">CAVALIER-SMITH, T. (2006). '''Rooting the tree of life by transition analyses'''. ''Biology Direct'' 1: 19p. {{Doi|10.1186/1745-6150-1-19}}</ref> (do [[língua grega|grego]]: [[Hades]], o submundo da mitologia).

 

O filo ''Deinococcus-Thermus'' consiste em uma única classe ( ''Deinococci'' ) e duas ordens:

 

 

** Filo '''[[Deinococcus - Thermus|''Deinococcus'' - ''Thermus'']]''' [Deinococcaeota <small>Oren et al. 2015</small> ]

** Classe '''Deinococci''' <small>Garrity e Holt 2002</small> ["Hadobacteria" <small>Cavalier-Smith 1992 emendam. Cavalier-Smith 1998</small> ; Hadobacteria <small>Cavalier-Smith 2002</small> ; "Xenobacteria"]

** Classe ''[[Oceanithermus]]'' <small>Miroshnichenko et al. 2003, a emenda. Mori et al. 2004</small>

** Gênero ''[[Rhabdothermus]]'' <small>Steinsbu et al. 2011</small>

 

Embora esses dois grupos tenham evoluído de um ancestral comum, os dois mecanismos de resistência parecem ser amplamente independentes.

 

Foram encontradas assinaturas moleculares na forma de assinaturas conservadas<ref>{{Citar periódico|data=2019-02-16|titulo=Conserved signature indels|url=https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Conserved_signature_indels&oldid=883576861|jornal=Wikipedia|lingua=en}}</ref> (CSIs) e proteínas (CSPs) que são compartilhadas de maneira única por todos os membros pertencentes ao filo ''Deinococcus-Thermus'' . Esses CSIs e CSPs são características distintivas que delineiam o filo único de todos os outros organismos bacterianos, e sua distribuição exclusiva é paralela às diferenças observadas na fisiologia. CSIs e CSPs também foram encontrados na ordem de suporte e na classificação taxonômica de nível familiar dentro do filo. Acredita-se que alguns dos CSIs encontrados para suportar distinções de nível de ordem desempenham um papel nas respectivas características extremofílicas<ref>{{Citar periódico|data=2019-07-14|titulo=Extremophile|url=https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Extremophile&oldid=906222762|jornal=Wikipedia|lingua=en}}</ref>. . Outrossim, alguns gêneros dentro deste grupo, incluindo ''Deinococcus'' , ''Thermus'' e ''Meiothermus'' , também possuem assinaturas moleculares que os demarcam como gêneros individuais, inclusive de suas respectivas espécies, fornecendo um meio de distingui-los do resto do grupo e de todas as outras bactérias. Os CSIs também foram encontrados específicos para o ''rádio-transmissor Truepera'' .

 

Em 2017<ref>{{Citar periódico|ultimo=Jiang|primeiro=Hai-Ying|ultimo2=Ma|primeiro2=Jing-E|ultimo3=Li|primeiro3=Juan|ultimo4=Zhang|primeiro4=Xiu-Juan|ultimo5=Li|primeiro5=Lin-Miao|ultimo6=He|primeiro6=Nan|ultimo7=Liu|primeiro7=Hai-Yang|ultimo8=Luo|primeiro8=Shu-Yi|ultimo9=Wu|primeiro9=Zheng-Jun|data=2017-10-25|titulo=Diets Alter the Gut Microbiome of Crocodile Lizards|url=http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2017.02073|jornal=Frontiers in Microbiology|volume=8|doi=10.3389/fmicb.2017.02073|issn=1664-302X}}</ref>, foi encontrado alta abundancia da bactéria ''Deinococcus-Thermus'' no intestino de crocodilo-lagarto selvagem na China<ref>{{Citar periódico|ultimo=Jiang|primeiro=Hai-Ying|ultimo2=Ma|primeiro2=Jing-E|ultimo3=Li|primeiro3=Juan|ultimo4=Zhang|primeiro4=Xiu-Juan|ultimo5=Li|primeiro5=Lin-Miao|ultimo6=He|primeiro6=Nan|ultimo7=Liu|primeiro7=Hai-Yang|ultimo8=Luo|primeiro8=Shu-Yi|ultimo9=Wu|primeiro9=Zheng-Jun|data=2017-10-25|titulo=Diets Alter the Gut Microbiome of Crocodile Lizards|url=http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2017.02073|jornal=Frontiers in Microbiology|volume=8|doi=10.3389/fmicb.2017.02073|issn=1664-302X}}</ref>, enquanto os de cativeiros, que se encontram doentes não havia a mesma concentração. Além disso, nas amostras selvagens da Reserva Natural de Luokeng, a alta prevalência de filo Deinococcus – Thermus no microbioma intestinal não foi encontrada em outros vertebrados. Deinococcus – Thermus spp. são geralmente encontrados em ambientes extremos. O papel do Deinococcus – Thermus no trato intestinal não é claro. No entanto, foi relatado que as bactérias Deinococcus – Thermus apresentam notável resistência a uma série de estresses, como radiação ionizante, radiação UV, agentes oxidantes e dessecação ( Theodorakopoulos et al., 2013<ref>{{Citar periódico|ultimo=Theodorakopoulos|primeiro=Nicolas|ultimo2=Bachar|primeiro2=Dipankar|ultimo3=Christen|primeiro3=Richard|ultimo4=Alain|primeiro4=Karine|ultimo5=Chapon|primeiro5=Virginie|data=2013-8|titulo=Exploration of Deinococcus-Thermus molecular diversity by novel group-specific PCR primers|url=http://doi.wiley.com/10.1002/mbo3.119|jornal=MicrobiologyOpen|lingua=en|paginas=n/a–n/a|doi=10.1002/mbo3.119|pmc=PMC3831646|pmid=23996915|acessodata=19 de julho de 2019}}</ref>). Portanto, a alta proporção de Deinococcus – Thermus pode ajudar os crocodilo lagarto a se adaptarem ao ambiente selvagem na Reserva Natural de Luokeng.

 

 

[[Genoma]] <ref>{{citar web|url=https://pt.wikipedia.org/wiki/Genoma|titulo=Genoma|data=|acessodata=19 de julho de 2019|publicado=wikipedia|ultimo=|primeiro=}}</ref> pode ser composto por DNA ou RNA, é um código genético, que possui toda a informação hereditária de um ser, e é codificada no DNA. É o conjunto de todos os diferentes genes<ref>{{citar web|url=https://pt.wikipedia.org/wiki/Gene|titulo=Genes|data=|acessodata=19 de julho de 2019|publicado=wikipedia|ultimo=|primeiro=}}</ref> que se encontram em cada núcleo de uma determinada espécie. Atualmente existem 10 genomas sequenciados<ref>{{Citar periódico|ultimo=Gilbert|primeiro=David|data=2009-03-12|titulo=DOE Joint Genome Institute 2008 Progress Report|url=http://dx.doi.org/10.2172/949770}}</ref><ref>{{Citar web|titulo="A genomic encyclopedia of bacteria and archaea" talk by Jonathan Eisen|url=http://dx.doi.org/10.4016/7258.01|obra=SciVee|data=2008-09-07|acessodata=2019-07-19}}</ref> de cepas neste filo: