Lectina do tipo C
Uma lectina tipo C (CLEC) é um tipo de domínio proteico de ligação a carboidratos de proteínas lectinas.[1] A designação tipo C refere-se ao seu requisito de cálcio para ligar-se.[2] As proteínas que contêm domínios de lectina tipo C apresentam uma gama diversificada de funções incluindo a adesão célula a célula, resposta imune a patógenos e apoptose.[3][4]
| Domínio de lectina do tipo C | |
|---|---|
 | |
| Indicadores | |
| Símbolo | Lectin_C |
| Pfam | PF00059 |
| InterPro | IPR001304 |
| SMART | CLECT |
| SCOP | 2msb |
| CDD | cd00037 |
| Estruturas PDB disponíveis: 1jznB:20-133 1muqB:20-133 1gz2A:22-140 1v4lD:44-146 1c3aB:44-146 1umrD:44-146 1uosB:44-146 1u0nC:19-123 1fvuD:19-123 1u0oB:19-123 1ijkC:19-123 1ixxD:42-144 1x2wB:42-144 1x2tD:42-144 1bj3B:42-144 1j35B:42-144 1j34B:42-144 1ukmB:44-148 1v7pB:44-148 1sb2B:21-125 1uv0A:57-173 1qddA:53-164 1lit :53-164 2afpA:58-161 1tdqB:1931-2036 1t8cA:180-284 1t8dA:180-284 1kje :180-284 1hli :180-284 1hlj :203-307 1eggA:669-779 1egiA:669-779 1k9iG:273-379 1sl5A:273-379 1sl4A:273-379 1sl6C:285-391 1xphA:285-391 1k9jA:285-391 1xarB:285-391 1dv8A:171-279 1wmzB:20-137 1wmyA:20-137 2brsA:114-222 1h8uA:114-222 1wk1A:1207-1314 1r13A:144-248 1r14A:144-248 1gieA:144-248 1msbA:134-236 1kwyC:134-236 1bch2:134-236 1kwwA:134-236 1kwxC:134-236 1yttA:134-236 1kwuB:134-236 3kmb3:134-236 1afb2:134-236 1kwtC:134-236 1fihC:134-236 1bcj2:134-236 4kmb3:134-236 1kx0C:134-236 1fifA:134-236 1kx1A:134-236 1kmb3:134-236 2kmb2:134-236 1kwvC:134-236 1afa2:134-236 1kwzA:134-236 1rtm2:134-236 1afd3:134-236 1buuA:134-236 2msbB:134-236 1hup :144-246 1rdj2:140-242 1bv4D:140-242 1kzd1:140-242 1rdo2:140-242 1rdm1:140-242 1rdl2:140-242 1rdi2:140-242 1kze2:140-242 1rdn1:140-242 1rdk1:140-242 1kzc1:140-242 1kzb2:140-242 1kza2:140-242 1pw9A:270-375 1b08A:270-375 1pwbA:270-375 1htnA:87-199 1tn3 :87-199 1rjhA:87-199 1g1qA:49-160 1g1sB:49-160 1kjd :49-160 1g1rB:49-160 1kjb :46-157 1esl :29-140 1kja :29-140 1g1tA:29-140 1byfA:10-121 1tlgB:10-121 1qo3C:156-255 1ja3A:160-259 1p4lD:160-259 1p1zD:160-259 1e87A:102-196 1e8iA:102-196 1fm5A:102-196 1b6e :78-176 1ypuB:161-224 1yxkB:161-224 1ypoC:161-224 1yxjA:161-224 1ypqB:161-224 1hyrA:116-213 1kcgB:116-213 1mpuA:116-213 1hq8A:132-229 | |
Clasificação editar
Drickamer et al. classificaram as lectinas tipo C em 7 subgrupos (do I ao VII) baseando-se na ordem de vários domínios proteicos em cada proteína.[5] Esta classificação foi posteriormente actualizada em 2002, juntando-se a ela sete subgrupos adicionais (do VIII ao XIV).[6] Mais recentemente, juntaram-se mais três subgrupos (do XV ao XVII).[1]
| Grupo | Nome | Domínios associados |
|---|---|---|
| I | Lecticanas | EGF, domínios Sushi Ig e Link |
| II | Asialoglicoproteína e receptores DC | Nenhum |
| III | Colectinas | Nenhum |
| IV | Selectinas | domínios Sushi e EGF |
| V | receptores da célula NK | Nenhum |
| VI | receptores endocíticos multi CTLD | domínios FnII e Ricin |
| VII | grupo Reg | Nenhum |
| VIII | Condrolectina, Layilina | Nenhum |
| IX | Tetranectina | Nenhum |
| X | Policistina | domínios WSC, REJ, PKD |
| XI | Atractina (ATRN) | domínios PSI, EGF e CUB |
| XII | Proteína básica maior eosinófila (EMBP) | Nenhum |
| XIII | DGCR2 | Nenhum |
| XIV | Trombomodulina, CD93, CD248 | dominio EGF |
| XV | Bimlec | Nenhum |
| XVI | SEEC | dominios SCP e EGF |
| XVII | CBCP/Frem1/QBRICK | dominios de repetições CSPG e CalX-beta |
Entre os CLEC estão os seguintes:
- CLEC1A, CLEC1B
- CLEC2A, CLEC2B, CD69 (CLEC2C), CLEC2D, CLEC2L
- CLEC3A, CLEC3B
- CLEC4A, CLEC4C, CLEC4D, CLEC4E, CLEC4F, CLEC4G, ASGR1 (CLEC4H1), ASGR2 (CLEC4H2), FCER2 (CLEC4J), CD207 (CLEC4K), CD209 (CLEC4L), CLEC4M
- CLEC5A
- CLEC6A
- CLEC7A
- OLR1 (CLEC8A)
- CLEC9A
- CLEC10A
- CLEC11A
- CLEC12A, CLEC12B
- CD302 (CLEC13A), LY75 (CLEC13B), PLA2R1 (CLEC13C), MRC1 (CLEC13D), MRC2 (CLEC13E)
- CLEC14A
- CLEC16A
- CLEC17A
Os "receptores de tipo lectina da célula NK" estão muito estreitamente relacionados com este grupo:[7]
- KLRA1
- KLRB1 (CLEC5B)
- KLRC1, KLRC2, KLRC3, KLRC4
- KLRD1
- KLRF1 (CLEC5C)
- KLRG1 (CLEC15A), KLRG2 (CLEC15B)
- KLRK1
Outras proteínas que contêm este domínio são:
- AGC1; ATRNL1
- BCAN
- CD248; CD72; CD93; CHODL; CL-K1-Ia; CL-K1-Ib; CL-K1-Ic; CLECSF5; COLEC10; COLEC11; COLEC12; CSPG3
- FCER2; FREM1; HBXBP;
- LAYN; LOC348174; LOC728276
- MAFA; MBL2; MGC34761; MICL; MRC1L1
- OLR1
- PAP; PKD1; PKD1L2; PLA2R1; PRG2; PRG3
- REG1A; REG1B; REG3A; REG3G; REG4
- SELE; SELL; SELP; SFTPA1; SFTPA2; SFTPA2B; SFTPD; SRCL
- THBD
- VCAN
Referências
- ↑ a b Zelensky AN, Gready JE (Dezembro de 2005). «The C-type lectin-like domain superfamily». FEBS J. 272 (24): 6179–217. PMID 16336259. doi:10.1111/j.1742-4658.2005.05031.x
- ↑ MeSH C-Type+Lectin
- ↑ Drickamer K (Outubro de 1999). «C-type lectin-like domains». Curr. Opin. Struct. Biol. 9 (5): 585–90. PMID 10508765. doi:10.1016/S0959-440X(99)00009-3
- ↑ Cambi A, Figdor C (Maio de 2009). «Necrosis: C-type lectins sense cell death». Curr. Biol. 19 (9): R375–8. PMID 19439262. doi:10.1016/j.cub.2009.03.032
- ↑ Drickamer K (1993). «Evolution of Ca(2+)-dependent animal lectins». Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Progress in Nucleic Acid Research and Molecular Biology. 45: 207–32. ISBN 978-0-12-540045-9. PMID 8341801. doi:10.1016/S0079-6603(08)60870-3
- ↑ Drickamer K, Fadden AJ (2002). «Genomic analysis of C-type lectins». Biochem. Soc. Symp. (69): 59–72. PMID 12655774
- ↑ MeSH NK+Cell+Lectin-Like+Receptors
Ligações externas editar
- Functional Glycomics Gateway, uma colaboração entre o Consortium for Functional Glycomics e o Nature Publishing Group