O Campeonato Amador de Guayaquil de 1946 ou mais conhecido como Liga Guayaquil de 1946 foi a 26ª edição dos torneios amadores de Guayas, este torneio foi organizado pela Federação Equatoriana de Guayaquil de Futebol, e no qual a equipe Emelec seria vista como campeã, para esta ocasião, após a redução de 12 para 6 equipes na temporada passada, foi necessário implementar que o torneio fosse disputado em partidas de ida e volta como uma inovação, além disso, o campeão desta edição representaria o Equador no Campeonato Sul-Americano de Campeões de 1948 a ser disputado; no Chile, a equipe 9 de Octubre obteria o quinto vice-campeonato, o terceiro consecutivo[1][2].
O Emelec obteria o título pela primeira vez neste torneio, enquanto o 9 de Octubre obteria o quinto vice-campeonato.
