A Polícia do Exército mantém no seu seio diversas subunidades especializadas para o cumprimento de funções especiais. De entre estas destacam-se:
* Módulo de Segurança do Elemento de Defesa NBQ (Nuclear, Biológica e Química) - subunidade vocacionada para a segurança de área e das equipas de reconhecimento NBQ;
* SecçõesPelotões de controloControlo de tumultosTumultos - forças destinadas à manutenção da ordem pública em apoio das autoridades militares ou civis (CRC - Crowd and Riot Control);
* SecçãoEquipas de Proteção Pessoal - subunidade vocacionada para a [[segurança pessoal]] de altas entidades, em proveito das forças nacionais destacadas (FND) no exterior, das forças de resposta da [[OTAN]] (NFRNRF, ''NATO response forces'') e dos agrupamentos de combate da [[União Europeia]];
* Secções moto - forçasForça de batedores motociclistas, de grande flexibilidade, especialmente vocaionadasvocacionadas para a escolta de colunas militares e para o controlo de tráfego;
* Secção Cinotécnica - Emprego de Binómios de Uso da Força, Detecção de Estupefacientes, Detecção de Explosivos.
* Equipas cinotécnicas - forças destinadas a servir de fator multiplicador das secções de controlo de tumultos, a executar missões de patrulhamento e a garantir a proteção imediata do pessoal, instalações e meios militares.
