Pfam
Pfam é uma base de dados de famílias de proteínas em que constam as sua anotações e alinhamentos múltiplos de sequências gerados com base nos modelos ocultos de Markov.[1][2][3]
Referências
- ↑ Finn RD, Tate J, Mistry J, Coggill PC, Sammut SJ, Hotz HR, Ceric G, Forslund K, Eddy SR, Sonnhammer EL, Bateman A (2008). «The Pfam protein families database». Nucleic Acids Res. 36 (Database issue): D281–8. PMC 2238907
. PMID 18039703. doi:10.1093/nar/gkm960
- ↑ Finn, R. D.; Mistry, J.; Schuster-Böckler, B.; Griffiths-Jones, S.; Hollich, V.; Lassmann, T.; Moxon, S.; Marshall, M.; Khanna, A.; Durbin, R.; Eddy, S. R.; Sonnhammer, E. L.; Bateman, A. (janeiro de 2006). «Pfam: clans, web tools and services» (Free full text). Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D247–D251. ISSN 0305-1048. PMC 1347511 . PMID 16381856. doi:10.1093/nar/gkj149
- ↑ Bateman, A.; Coin, L.; Durbin, R.; Finn, R. D.; Hollich, V.; Griffiths-Jones, S.; Khanna, A.; Marshall, M.; Moxon, S.; Sonnhammer, E. L.; Studholme, D. J.; Yeats, C.; Eddy, S. R. (2004). «The Pfam protein families database». Nucleic Acids Research. 32 (Database issue): 138D–1141. ISSN 0305-1048. PMC 308855 . PMID 14681378. doi:10.1093/nar/gkh121
Ligações externas editar
- Pfam - Base de dados de famílias de proteínas no Sanger Institute, UK.
- Pfam - Base de dados de famílias de proteínas no Janelia Farm Research Campus, USA.
- Pfam - Base de dados de famílias de proteínas no Center for Genomics and Bioinformatics, Suécia.
- iPfam - Interações de domínios Pfam em PDB.