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Taxonomia do domínio Archaea

Esta é uma lista taxônomica do domínio Archaea.

Archaea é um domínio de seres procariotas, quimiotróficos e extremófilos. A seguinte lista mostra a taxonomia do grupo até o nível de gênero, baseado nas classificações de Garrity e colaboradores (2007) [1] e Euzéby (2009) [2].

Halobacterium sp.

Taxonomia

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Observações

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Dois outros possíveis filos são descritos na literatura, Korarchaeota e Nanoarchaeota, entretanto suas validades são questionadas, não constando na última edição do Bergey's Manual of Systematic Biology (2004/05). Em 2008, um novo filo foi proposto, o Thaumarchaeota, para abrigar arquéias mesófilas.

Conhecida somente de seqüências genéticas de ARNr 16S obtida de amostras de fontes hidrotermais de alta temperatura do Parque Yellowstone. Análise do material sugere que não pertence aos outros grupos principais de arquéias, Crenarchaeota e Euryarchaeota, sendo de origem mais antiga. Entretanto, é possível que o Korarchaeota não seja um grupo separado, mas simplesmente um organismo que tenha sofrido uma mutação rápida ou não usual do gene ARNr 16S. [3] [4]

Filo criado em 2002 para abrigar a espécie hipertermófila Nanoarchaeum equitans cujas relações de parentesco são incertas. Ao comparar a seqüência ARNr com as dos outros dois filos, são encontradas diferenças tão grandes quantos a diferença entre ambos os filos. Outros pesquisadores, no entanto, sugerem que esta arquéia seja relacionada as Thermococcales, do filo Euryarchaeota. [5] [6] [7]

O filo foi proposto baseado em dados filogenéticos, como seqüência de RNA ribossômico, e a presença de uma forma de topoisomerase tipo I, que previamente era encontrada apenas em eucariontes, para abrigar arquéias mesofílicas, que até então eram agrupadas no filo Crenarchaeota. [8] [9]

Referências

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  1. ↑ GARRITY, G. M.; LILBURN, T. G.; COLE, J. R., HARRISON, S. H.; EUZÉBY, J.; TINDALL, B. J. Archaea In Taxonomic Outline of the Bacteria and Archaeae (TOBA) Arquivado em 1 de dezembro de 2008, no Wayback Machine.. Versão 7.7 de 6 de março de 2007. Acessado em 20 de novembro de 2008.
  2. ↑ EUZÉBY, J. P. Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria) Arquivado em 27 de janeiro de 2013, no Wayback Machine.. In List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) Arquivado em 16 de maio de 2011, no Wayback Machine.. Acessado em 12 de dezembro de 2009.
  3. ↑ AUCHTUNG, T. A.; TAKACS-VESBACH, C. D.; CAVANAUGH, C. M. (2006). 16S rRNA Phylogenetic Investigation of the Candidate Division “Korarchaeota”. Appl. Environ. Microbiol. 72 (7): 5077–5082. Abstract
  4. ↑ BARNS, S. M.; DELWICHE, C. F.; PALMER, J. D.; PACE, N. R. (1996). Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences. PNAS 93 (17): 9188-9193. Abstract
  5. ↑ HUBER, H.; HOHN, M. J.; RACHEL, R.; FUCHS, T.; WIMMER, V.C.; STETTER, K. O. (2002). A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont. Nature 417 (6884): 27 – 8. Abstract
  6. ↑ WATERS, E. et al. (2003). The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism. Proceedings of the National Academy of Sciences 100 (22): 12984-8. Abstract
  7. ↑ BROCHIER, C.; GRIBALDO, S.; ZIVANOVIC, Y.; CONFALONIERI, F.; FORTERRE, P. (2005). Nanoarchaea: representatives of a novel archaeal phylum or a fast-evolving euryarchaeal lineage related to Thermococcales?. Genome Biology 6 (5): R42. Abstract
  8. ↑ BROCHIER-ARMANET, C.; BOUSSAU, B.; GRIBALDO, S.; FORTERRE, P. (2008). Mesophilic Crenarchaeota: proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota. Nature Review Microbiology 6 (3): 245-253. Abstract
  9. ↑ BROCHIER-ARMANET, C.; GRIBALDO, S.; FORTERRE, P. (2008). A DNA topoisomerase IB in Thaumarchaeota testifies for the presence of this enzyme in the last common ancestor of Archaea and Eucarya. Biology Direct 3: 54. Completo Abstract

Bibliografia adicional

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  • GARRETT, R. A.; KLENK, R.-P. Archaea: Evolution, Physiology and Molecular Biology. Malden (Maryland): Blackwell Publishing, 2007. 288 p.
  • GARRITY, G. M. (ed.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology volume 2: parts A, B and C. 2ª ed. Nova Iorque: Springer-Verlag, 2005.
  • GARRITY, G. M.; BELL, J. A.; LILBURN, T. G. Taxonomic Outline of the Prokaryotes Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 2ª ed. versão 5.0 de maio de 2004. Nova Iorque: Springer-Verlag, 2004.
  • GARRITY, G. M. (ed.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria. 2ª ed. Nova Iorque: Springer-Verlag, 2002.

Ligações externas

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